Arti warna Lambang Daerah adalah:

• Warna Biru melambangkan persaudaraan;
• Warna Hijau melambangkan keagamaan, keluhuran dan kemashuran;
• Warna Kuning melambangkan keagungan dan kemashuran;
• Warna Biru melambangkan persaudaraan;
• Warna Putih melambangkan kesucian;
• Warna Coklat melambangkan kedamaian/ketentraman; dan
• Warna Merah melambangkan dalam kebenaran.
  

Arti Lambang tersebut adalah sebagai berikut:

1. Lambang yang berbentuk perisai yang berarti ketahanan wilayah yang tangguh
2. Bintang bersudut 5 (lima) melambangkan Dasar Falsafah Negara Republik Indonesia yang berdasarkan Pancasila;
3. Padi dan Kapas melambangkan Pemerintahan yang berkeadilan social dan sekaligus pula merupakan rangkaian sejarah terbentuknya Daerah Kota Tarakan; Untaian Padi sebelah luar berjumlah 15 (lima belas) dab sebelah dalam berjumlah 12 (dua belas) melambangkan tanggal dan bulan peresmian Daerah Kota Tarakan; Untaian Kapas sebelah dalam berjumlah 9 dan sebelah luar 7 butir, melambangkan tahun 1997, tahun peresmian Daerah Kota Tarakan; dan Ikatan Padi dan Kapas berjumlah 7 lilitan, melambangkan bahwa Daerah Kota Tarakan merupakan Daerah yang ke 7 di Provinsi Kalimantan Timur serta merupakan ikatan persatuan dan kesatuan;
4. Menara Minyak dengan semburan gas pada puncaknya melambangkan potensi masa lampau yang memberikan kontribusi pendapatan nasional;
5. Perisai merupakan alat pelindung untuk mencapai tujuan Negara Republik Indonesia;
6. Mandau dan Dayung melambangkan kesiapan masyarakat pembangunan;
7. Guci air yang terletak ditengah perisai melambangkan potensi sumber daya manusia Daerah Kota Tarakan;
8. Garis ombak berwarna putih melambangkan ketentraman dan kedamaian yang selalu menaungi seluruh warga Daerah Kota Tarakan; dan
9. Tulisan yang ada dalam lambing daerah adalah Paguntaka yang berasal dari bahasa Tidung yang berarti Kampung Kita.